医卡通系统是医院信息化基础工作的重要内容，包含：办卡模块、充值、退费模块、患者费用明细管理模块、发票打印（撤销重打）模块、收费员报账管理模块、工作量统计功能模块、门诊/住院科室收入管理模块、医保结算模块、备付金管理模块、诊疗服务费管理模块等基础功能，系统实行夫妻双方卡绑定同一账户的办卡建档模式，不仅使患者夫妻双方的信息进行了有效的关联，而且在就诊过程中夫妻双方均可使用同一账户的资金，优化了患者的就诊流程；系统的工作量统计包括：收费员工作量统计和临床工作量统计功能，满足临床部门对自己科室的工作量的及时查阅的同时，通过对各科室的工作量和核心指标的统计，大大方便了财务和医务人员对各科室工作量的整合；科室收入报表统计功能：通过抽取医院的业务数据，然后按照指定的科室收入分配规则，对现有的业务流程进行开单、执行的分配，进而实现对医院科室的开单、执行的收入分配，精细化的分配方案，使科室的收入分配更加合理，系统实现了市医保、省医保、异地医保的结算，方便患者的进行医保结算。